1. 孙宁华，2021，主持国家社科基金课题：数字货币的宏观经济效应及货币政策调控机理研究，国家社科基金委员会，项目批准号：21BJL027
2. 孙宁华，2021年，主持江苏省高等教育教改研究立项课题：中国经济学教学科研实践三元融合创新体系，江苏省教育厅
3. 孙宁华, 2015-2018, 主持教育部人文社会科学重点研究基地重大项目：扭转区域发展不平衡中长三角的角色、任务与机制研究
4. 孙宁华, 2010-2013, 主持国家社科基金课题：中国宏观经济数据校准和改进方法研究,国家社会科学基金委员会,项目编号:10BJY017
5. 孙宁华, 2004-2005, 主持：南京大学创建世界一流大学双语教学项目, 南京大学
6. 孙宁华, 2003, 主持国家社科基金课题：金融衍生工具风险形成与管理, 国家社会科学基金委员会, 编号:05&ZD033